В марте 1940 года здесь была захоронена урна с прахом Булгакова. Позже на могильном камне была сделана надпись: «Писатель Михаил Афанасьевич Булгаков. 1891–1940». Спустя 30 лет, в июле 1970 года, рядом с мужем похоронили Елену Сергеевну.

Не только при жизни, но и после смерти имя Булгакова осталось прочно связанным с Николаем Гоголем, а реплику «Укрой меня своей чугунною шинелью» (из письма Булгакова к П. Попову от 1932 года) толкователи считают авторским пророчеством. Е. С. Булгакова вспоминала, что первые годы могилу мужа украшали высаженные цветы и грушевые деревья. Спустя некоторое время в мастерской при кладбище она обнаружила гранитную глыбу — по словам директора мастерской, это был камень-голгофа с могилы Гоголя. По просьбе вдовы камень перенесли на могилу Булгакова. Позднее на нем была сделана надпись золотыми буквами: «Писатель Михаил Афанасьевич Булгаков. 1891–1940». Кроме Елены Сергеевны, которая покоится рядом с мужем, на Новодевичьем кладбище похоронена сестра Булгакова, Надежда Афанасьевна, и родственники по линии Земских: Марья Даниловна, Борис Михайлович, Андрей Михайлович и другие.